By the time we reach June, you will all become high school graduates.
6月までに、君たち全員が高校の卒業生になります。
by the time ...(~するときまでに)は、3語がひとまとまりとなって1つの接続詞の働きをしています。このような例はほかにもありますが、as soon as ...(~するやいなや)、as long as ...(~するかぎり)、the moment(minute)...(~する瞬間)など、時に関するものがかなり多いです。これらは時を表す副詞節なので、未来のことを表す場合は動詞を現在形にすることに気をつけましょう。