I thought over Sophia's offer again.
私、ソフィアのオファーをもう一度よく考えてみたの。
「申し出に対してよく考える」という局面で用いられる表現です。think over は、「(何か決断する前に)よく考える」という意味のことばです。again と言っているので「(一度考えたけれど)もう一度考える」ということになります。thought とあるので、すでにそれ(もう一度考えること)が過去であることを示しています。過去形にはしばしば、きっぱりと過去を切り離して「今」があるというニュアンスがあり、「もう決心がついた」という覚悟が感じられます。think over はその意味の性質上、「時間をかける」という表現と結び付きやすくもあります。