I'd send an email saying something like despite my efforts to stay healthy during this cold and flu season, I woke up this morning feeling sick.

こんなふうなメールを書いて送るでしょう。「風邪やインフルエンザが流行するこの季節には、健康維持に努めているのですが、今朝起きてみると、体調がすぐれませんでした」。